La fat16 o fat32 es un sistema de archivos de sistemas operativos a 16 y 32bit, mintras que los de 32bit reales, llamales NT4, Windows2k y Xp trabajan con una NTFS, que es otro sistema, este lo utilizan para mayor seguridad de sus equipos a mayor nivel.
Que pasa .. vos podes instalar un NT o Similar en fat32 o en una NTFS, pero no asi un windows98 que va siempre en un FAT32
Es solo otro sistemas mas seguro de archivo, que trabaja con el sistema operativo en conjunto en donde la flexibilidad en la seguridad se torna mas rigida que en los SO menos complicados.
Saludos.
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