BUENO GRACIAS ATODOS LOS K APORTARON ALGO YA LO SOLUCIONE Y AKI ESTA EL CODIGO FINAL :
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <time.h>
void menu();
void buscarIsbn(char x[11]);
void buscarLibro(char lib[50]);
void asociarAutor(char m[11]);
void asociarLibro(char u[11]);
void agregarLibro();
void buscarAutor(char [30]);
int compararIsbn(char [11]);
int compararAutor(char [30], char [11]);
FILE *libros,*autores;
int main()
{ system("CLS");
menu();
return 0;
}
void menu()
{ int op,n;
char num[11],texto[50],nombre[30];
clock_t inicio,final;
do{
system("CLS");
printf( "\t\t\t MENU\n\n" );
printf( "\t\t1. Buscar libro por ISBN\n" );
printf( "\t\t2. Buscar libros por autor o titulo\n" );
printf( "\t\t3. Agregar un nuevo libro\n" );
printf( "\t\t4. Exit\n" );
printf( "\t\tSeleccion --> " );
scanf( "%d", &op );
switch ( op ) {
case 1: {
printf("Ingrese ISBN: ");
fflush(stdin);
gets(num);
if(num[10]!='\0')
printf("El codigo ISBN debe tener 10 digitos!\n");
if(num[0]=='*')
{ inicio=clock();
buscarIsbn(num);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
else
{ inicio=clock();
buscarIsbn(num);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
break;
}
case 2:
system("cls");
printf("(1) Busqueda por autor\n");
printf("(2) Busqueda por Titulo\n");
scanf("%d",&n);
system("CLS");
if(n==1)
{
printf("Ingrese Autor(Apellido, Nombre):");
fflush(stdin);
gets(nombre);
if(nombre[0]=='*')
{
inicio=clock();
buscarAutor(nombre);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
else
{
inicio=clock();
buscarAutor(nombre);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
}
if(n==2)
{
printf("Ingrese titulo ");
fflush(stdin);
gets(texto);
if(texto[0]=='*')
{
inicio=clock();
buscarLibro(texto);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
else
{
inicio=clock();
buscarLibro(texto);
final=clock();
printf("\nTiempo de procesamiento %d milisegundos\n",(final-inicio));
}
}
break;
case 3:
agregarLibro();
break;
case 4:
printf( "Gracias por usar nuestro servicio de Biblioteca!\n" );
break;
default:
printf( "\tEsta opcion no es valida!\n" );
break;
}
system("PAUSE");
}while( op != 4 );
}
//agrega los datos al final del archivo
void agregarLibro()
{
char titulo[50],autor[30],num[11],sino;
int stop;
do{
stop=1;
fflush(stdin);
printf( "Ingresar datos del libro: \n" );
printf( "\tCodigo ISBN: " );
gets(num);
if(num[10]!='\0')
{printf("El codigo ISBN debe tener 10 digitos!\n");
break;}
if(compararIsbn(num)==1)
{printf("Ese libro ya fue ingresado!\n");
break;}
printf( "\tTitulo: " );
gets(titulo);
printf( "\tAutor con el formato (Apellido, Nombre): " );
gets(autor);
libros=fopen("libros.txt", "a"); // abre el archivo libros para escribirlo
// escribe los datos ingresados al archivo libros
fprintf(libros, "%s %s\n" ,num,titulo);
;
if( compararAutor(autor,num) == 0)
{ autores=fopen("autores.txt", "a"); // abre el archivo autores para escribirlo
// escribe los datos ingresados al archivo autores
fprintf(autores, "%s: %s\n",autor,num);
}
printf( "Desea ingresar otro autor (s/N): " );
scanf("%c",&sino);
if( (sino == 's') || (sino == 'S') ) // ver si quiere ingresar mas datos
{
stop=0;
}
}while( stop == 0);
fclose(libros); // cierra el archivo libros
fclose(autores); // cierra el archivo autores
}
int compararAutor(char nombre[30], char cod[11])
{
FILE *temp;
char linea[100],newline[100],nombre2[30];
int i,encontrado1=0;
if((autores=fopen("autores.txt","r"))==NULL) //Apertura de archivo libros
{
printf("ERROR APERTURA");
}
temp=fopen("temp.txt", "a");
while(!feof(autores))
{
fgets(linea,100,autores);
i=0; //Recorrer el archivo para buscar el autor
do
{
nombre2
= linea;
i++;
} while ( linea != ':' );
nombre2 = '\0';
if( strcmp(nombre2,nombre)==0)
{
strcpy(newline,linea);
newline[strlen(newline)-1]=' ';
strcat(newline,cod);
fprintf(temp,"%s\n",newline);
encontrado1=1;
}
else
{
fprintf(temp,"%s",linea);
}
}
fclose(autores);
remove("autores.txt");
fclose(temp);
rename("temp.txt","autores.txt");
printf("\nLibro ingresado con exito\n");
return encontrado1;
}
int compararIsbn(char cod[11])
{
char isbn[11],v[100];
int i,encontrado=0;
if((libros=fopen("libros.txt","r"))==NULL) //Apertura de archivo libros
{
printf("ERROR APERTURA");
}
while((!feof(libros))) //Recorre el archivo y obtiene isbn
{ fgets(v,100,libros);
for(i=0;i<10;i++)
isbn=v;
isbn[10]='\0';
if( strcmp(isbn,cod) == 0 )
encontrado=1;
}
fclose(libros);
return encontrado;
}
//busca el autor ingresado por el usuario
void buscarAutor(char nombre[30])
{int i,j,k;
char linea[100],nombre2[30],codigo[11];
//Apertura de archivo libros
if((autores=fopen("autores.txt","r"))==NULL)
{
printf("ERROR APERTURA");
}
if((libros=fopen("libros.txt","r"))==NULL)
{
printf("ERROR APERTURA");
}
if(nombre[0]=='*')
{
while((!feof(libros)))
{
fgets(linea,100,libros);
printf("%s",linea);
for(i=0;i<10;i++)
codigo=linea;
codigo[10]='\0';
asociarAutor(codigo);
}
}
else
{
//recorre el archivo completo
while(!feof(autores))
{
//lee una linea del archivo
fgets(linea,100,autores);
i=0;
//Recorrer el archivo para buscar el autor
do
{
nombre2 = linea;
i++;
} while ( linea != ':' );
nombre2 = '\0';
if( strcmp(nombre2,nombre)==0)
{
j=i+2;
while( linea[j] != '\0')
{ k=0;
while(k!= 10)
{
codigo[k] = linea[j];
j++;
k++;
}
j=j+1;
codigo[k]='\0';
asociarLibro(codigo);
printf("Autor: %s\n",nombre);
}
}
}
}
fclose(autores);
fclose(libros);
}
//asocia un libro al codigo isbn que se le entrega
void asociarLibro(char u[11])
{
char isbn[11],titulo[50],linea[100];
int j,k,i,encontrado=0;
if((libros=fopen("libros.txt","r"))==NULL) //Apertura de archivo libros
{
printf("ERROR APERTURA");
}
//Recorre el archivo
while((!feof(libros)) || (encontrado ==0))
{ //lee una linea del archivo
fgets(linea,100,libros);
//obtiene isbn
for(i=0;i<10;i++)
isbn=linea;
isbn[10]='\0';
k=0;
//Recorrer el archivo y separar
for(j=11;j<strlen(linea);j++) //e imprimir datos (TITULO)
{
titulo[k]=linea[j];
k++;
}
titulo[strlen(linea)-11]='\0';
if( strcmp(isbn,u) == 0 )
{
printf("%s %s",isbn,titulo);
encontrado =1;
}
}
fclose(libros);
}
void buscarIsbn(char x[11])
{
char isbn[11],titulo[50],v[100];
int j,k,i;
if((libros=fopen("libros.txt","r"))==NULL) //Apertura de archivo libros
{
printf("ERROR APERTURA");
}
if(x[0]=='*')
{
while((!feof(libros)))
{
fgets(v,100,libros);
printf("%s",v);
for(i=0;i<10;i++)
isbn=v;
isbn[10]='\0';
asociarAutor(isbn);
}
}
else
{
while((!feof(libros))) //Recorre el archivo y obtiene isbn
{ fgets(v,100,libros);
for(i=0;i<10;i++)
isbn=v;
isbn[10]='\0';
k=0;
//Recorrer el archivo y separar
for(j=11;j<strlen(v);j++) //e imprimir datos (TITULO)
{
titulo[k]=v[j];
k++;
}
titulo[strlen(v)-11]='\0';
if( strcmp(isbn,x) == 0 )
{
printf("%s %s",isbn,titulo);
asociarAutor(x);
}
}
}
fclose(libros);
}
void asociarAutor(char m[11])
{
int i,j,k;
char autor[30],v[100],codigo[11];
if(!(autores=fopen("autores.txt","r"))) //Apertura de archivo autores
{
printf("ERROR APERTURA");
}
while(!feof(autores))
{
fgets(v,100,autores);
i=0;
do
{
autor=v;
i++;
} while (v!=':');
autor='\0';
j=i+2;
while( v[j] != '\0' )
{ k=0;
while(k!= 10)
{
codigo[k]=v[j];
j++;
k++;
}
j=j+1;
codigo[10]='\0';
if( strcmp(codigo,m) == 0 )
{
printf("Autor: %s\n",autor);
}
}
}
fclose(autores);
}
void buscarLibro(char lib[50])
{
int i,j,k=0;
char titulo[50],v[100],isbn[11];
if( (libros=fopen("libros.txt","r")) == NULL ) //Apertura de archivo autores
{
printf("ERROR APERTURA");
}
if(lib[0]=='*')
{
while(!feof(libros))
{
fgets(v,100,libros);
printf("%s",v);
for(i=0;i<10;i++)
isbn=v;
isbn[10]='\0';
asociarAutor(isbn);
}
}
else
{
while(!feof(libros)) //Recorrer el archivo y separar
{ fgets(v,100,libros); //e imprimir datos (ISBN)
for(i=0;i<10;i++)
isbn=v;
isbn[10]='\0';
//Recorrer el archivo y separar
for(j=11;j<strlen(v);j++) //e imprimir datos (TITULO)
{
titulo[k]=v[j];
k++;
}
titulo[k-1]='\0';
k=0;
if( strcmp(titulo,lib) == 0 )
{
printf("%s %s\n",isbn,titulo);
asociarAutor(isbn);
}
}
}
fclose(libros);
}
USE UN ARCHIVO EXTRA Como decia baby girl y de ahi ocupe unas funciones de stdio.h que son el remove y rename que me fueron muy utiles
y tuve que compilar con turbo c ya que devc++ no me reconocia estas funciones gracias 
si a alguien le interesa despues subo el ejecutable con los archivos que trabaja 
me sirvio de ejercicio estaba muy oxidado en c
xao
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